MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002678	GGC	2	6	189540	189545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_002678	ACAGA	2	10	189604	189613	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
503	NC_002678	ACGCG	2	10	189615	189624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
504	NC_002678	GGC	2	6	189704	189709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_002678	ATC	2	6	189727	189732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_002678	CAC	2	6	190639	190644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_002678	CCG	2	6	190655	190660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_002678	AAG	2	6	191860	191865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_002678	GGC	2	6	191957	191962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_002678	CCG	2	6	192069	192074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_002678	CGT	2	6	192116	192121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_002678	CGGC	2	8	192147	192154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_002678	AC	3	6	192770	192775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_002678	ACA	2	6	192797	192802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_002678	GCG	2	6	193189	193194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_002678	GGC	2	6	193195	193200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_002678	GGAG	2	8	193229	193236	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
518	NC_002678	GCCG	2	8	193318	193325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_002678	ACAG	2	8	193344	193351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_002678	AG	3	6	193350	193355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_002678	CCG	2	6	193356	193361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_002678	GC	3	6	197576	197581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_002678	GCG	2	6	197593	197598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_002678	GGCG	2	8	197636	197643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
525	NC_002678	GCG	2	6	201898	201903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_002678	CAA	2	6	201976	201981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_002678	CGG	2	6	201998	202003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_002678	T	6	6	202005	202010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_002678	GGC	2	6	202043	202048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_002678	GAA	2	6	202096	202101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_002678	GAC	2	6	202851	202856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_002678	GCT	2	6	202876	202881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_002678	GGC	2	6	202939	202944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002678	GCG	2	6	204082	204087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002678	CCGG	2	8	204090	204097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_002678	GACCT	2	10	204108	204117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
537	NC_002678	GGC	2	6	204454	204459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_002678	G	6	6	204473	204478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
539	NC_002678	TCT	2	6	204507	204512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002678	GAAA	2	8	204531	204538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_002678	GCC	2	6	204631	204636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_002678	GCTTCC	2	12	204746	204757	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002678	GA	3	6	204860	204865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_002678	GCT	2	6	205267	205272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002678	GA	3	6	205296	205301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_002678	CGCGC	2	10	209184	209193	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
547	NC_002678	AAC	2	6	214393	214398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002678	CCCGT	2	10	214431	214440	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
549	NC_002678	AGA	2	6	214447	214452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_002678	GGC	2	6	214454	214459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002678	ACA	2	6	216556	216561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_002678	CGC	2	6	217151	217156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_002678	GGC	2	6	217196	217201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_002678	T	6	6	217207	217212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_002678	ATC	2	6	217633	217638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_002678	CGG	2	6	218974	218979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_002678	T	6	6	218992	218997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_002678	CGC	2	6	219099	219104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_002678	GGC	2	6	221128	221133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002678	GCAAGG	2	12	221168	221179	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
561	NC_002678	GGCC	2	8	221210	221217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_002678	GCCT	2	8	221252	221259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_002678	CGG	2	6	221750	221755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_002678	CGC	2	6	222184	222189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_002678	TCC	2	6	222210	222215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_002678	CGCC	2	8	222230	222237	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
567	NC_002678	TGG	2	6	222247	222252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_002678	GGAA	2	8	222262	222269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002678	CGG	2	6	223304	223309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_002678	AAC	2	6	223367	223372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002678	AAG	2	6	223375	223380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002678	GC	3	6	223891	223896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_002678	AAT	2	6	223920	223925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_002678	TCG	2	6	223961	223966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_002678	GGA	2	6	223991	223996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_002678	GC	3	6	224006	224011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_002678	TCTGC	2	10	224030	224039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
578	NC_002678	CGC	2	6	224093	224098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_002678	CCG	2	6	224104	224109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_002678	TC	3	6	224117	224122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_002678	CTG	2	6	224139	224144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002678	GAG	2	6	224205	224210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_002678	CCAAA	2	10	225521	225530	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
584	NC_002678	CCA	2	6	227544	227549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_002678	ACG	2	6	227565	227570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_002678	CGG	3	9	228539	228547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002678	GCAA	2	8	228550	228557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_002678	CCG	2	6	228563	228568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_002678	GCT	2	6	228569	228574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002678	CAA	2	6	228649	228654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002678	GGC	2	6	228699	228704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_002678	CTTC	2	8	228743	228750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_002678	GGC	2	6	228754	228759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002678	GAC	2	6	230461	230466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_002678	GAA	2	6	230895	230900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002678	GCG	2	6	231892	231897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002678	GGA	2	6	233731	233736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_002678	GGA	2	6	233780	233785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_002678	ATC	2	6	235690	235695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_002678	GAA	2	6	235752	235757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_002678	TTC	2	6	235781	235786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002678	GCC	2	6	235794	235799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_002678	GT	4	8	235826	235833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_002678	AGG	2	6	235840	235845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_002678	GC	3	6	235895	235900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_002678	GAC	2	6	235943	235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002678	CTTT	2	8	235965	235972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
608	NC_002678	TGA	2	6	236102	236107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_002678	GGC	2	6	236108	236113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_002678	CCG	2	6	236154	236159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_002678	GT	3	6	236222	236227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_002678	CGCGG	2	10	237319	237328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
613	NC_002678	CGC	2	6	237342	237347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_002678	A	7	7	237695	237701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_002678	GCC	2	6	237763	237768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_002678	TCG	2	6	237792	237797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_002678	CT	3	6	237847	237852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_002678	CATA	2	8	237866	237873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_002678	CGGGG	2	10	237973	237982	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
620	NC_002678	ACG	2	6	237991	237996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_002678	CGCT	2	8	238048	238055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_002678	GCTC	2	8	238070	238077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_002678	CCA	2	6	238087	238092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_002678	CCG	2	6	238109	238114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_002678	AG	3	6	238166	238171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002678	TGGC	2	8	238186	238193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_002678	CG	4	8	238196	238203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_002678	TGA	2	6	239716	239721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_002678	T	6	6	239724	239729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_002678	GATG	2	8	239730	239737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_002678	T	6	6	239741	239746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002678	GGA	2	6	239747	239752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002678	A	7	7	240122	240128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_002678	CCT	2	6	240360	240365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_002678	TGA	3	9	240383	240391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_002678	CTC	2	6	240393	240398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_002678	CGG	2	6	243997	244002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_002678	GGC	2	6	245791	245796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_002678	ATG	2	6	245813	245818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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